1.天野郁夫著，陈武元等译：《日本高等教育改革：现实与课题》，厦门大学出版社2014年版。

2.天野郁夫著，陈武元译：《高等教育的日本模式》，教育科学出版社2006年版。

3.关正夫著，陈武元译：《日本高等教育的改革动向》，厦门大学出版社1991年版。

4.陈武元编：《萨本栋博士百年诞辰纪念文集》，厦门大学出版社2004年版。

5.陈武元（副主编）：《留学教育文集》，厦门大学出版社1993版。

（在《教育研究》、《高等教育研究》、《比较教育研究》、《大学论集》（日本）、《大学财务经营研究》（日本）等国内外重要学术期刊上发表论文60余篇，其中有近50篇发表在CSSCI来源期刊上）

1.陈武元：“中国高校毕业生就业制度的研究”（日文），《大学论集》（日本广岛大学大学教育研究中心主办）1998年度第29集。

2.陈武元，邬大光：“中国大学学院制改革”（日文），《高等教育研究丛书》（日本广岛大学大学教育研究中心主办）1999年第54集。

3.陈武元，张彤：“中国高等教育评价的回顾与展望”（日文），《高等教育研究丛书》（日本广岛大学大学教育研究中心主办）2000年第62集。

4.陈武元，大崎素史：“中国民办高等教育机构的现状及其存在问题”（日文），《教育学部论集》（日本创价大学教育学部主办）2003年第54集。

5.陈武元，邬大光：“中国高等教育大众化背景下新制二级学院的作用及其存在问题”（日文），《研究报告》（日本文部科学省多媒体教育开发中心主办）2004年第51集。

6.陈武元：“中国大学政策与研究型大学经费筹措”（日文），《大学财务经营研究》（日本国立大学财务经营中心主办）2005年第2期。

7.陈武元：“日本高等教育与经济发展的关系”，《清华大学教育研究》1999年第3期。

8.陈武元：“研究型大学办高职的反思——厦门大学的个案分析”,《现代大学教育》2006年第5期。

9.陈武元：“关于制定地方民办教育管理条例的思考”，《教育研究》2006年第11期。

10.陈武元，薄云：“试析菲律宾私立高等教育的政府资助体系”，《高等教育研究》2006年第12期。

11.陈武元：“制定地方民办教育管理条例的思考:以S市为例”，《教育发展研究》2006年第12B期。

12.陈武元，薄云：“20世纪末以来韩国私立大学的重组改革”，《比较教育研究》2007年第1期。

13.陈武元，薄云：“马来西亚私立高等教育评估认证制度研究”，《南洋问题研究》2007年第1期。

14.陈武元：“日本研究型大学经费筹措研究”，《江苏高教》2007年第2期。

15.陈武元，薄云：“马来西亚私立高等教育国际化论析”，《外国教育研究》2007年第2期。

16.陈武元，洪真裁：“关于中国高校分类与定位问题的思考”，《现代大学教育》2007年第2期。

17.陈武元，薄云：“菲律宾私立高等教育认证制度研究”，《厦门大学学报(哲社版)》2007年第2期。

18.陈武元，洪真裁：“建国后17年中国高等教育发展评价与启示”，《东南学术》2007年第3期。

19.陈武元，洪真裁：“中国一流大学建设的关键因素探析”，《东南学术》2008年第1期。

20.陈武元，薄云：“韩国、马来西亚、菲律宾三国私立高等教育经费研究”，《高等教育研究》2008年第2期。

21.陈武元：“论私立高等教育发展的制度环境——兼论中国民办高等教育发展的制度环境选择”，《教育发展研究》2008年第5－6期。

22.陈武元：“从补充教育走向选择教育：我国民办高校发展的必然选择”，《教育研究》2008年第5期。

23.陈武元：“我国普通高校经费筹措的实证研究”，《教育发展研究》2009年第7期。

24.陈武元：“中国民办高校如何走出办学水平不高的困境——经费来源结构的视角”，《教育研究》2011年第7期。

25.陈武元：“科研规划与文科学科建设关系的理性思考”，《复旦教育论坛》2011年第3期。

1.陈武元、王日春：《全国高校“十五”哲学社会科学的回顾与展望》（研究报告），2006年6月被教育部社科司采纳。

2.陈武元、王日春：《教育部人文社会科学重点研究基地“十五”建设的回顾与展望》（研究报告），2006年6月被教育部社科司采纳。

3.陈武元：《关于进一步加强和改进省社科规划工作的实施意见》（研究报告），2008年5月被福建省社科联采纳。

4.陈武元：《厦门市高职院校校内管理规章制度建设》（研究报告），2009年9月被厦门市教育局采纳。

5.陈武元：《福建省哲学社会科学研究“十二五”规划（2011-2015年）》（研究报告），2010年12月被福建省社科联采纳。

6.陈武元：《非营利性民办高校管理的制度框架设计》（研究报告），2012年12月被福建省教育厅采纳。

7.陈武元：《完善非营利性民办高校法人治理结构若干规定》（研究报告），2012年12月被福建省教育厅采纳。

8.陈武元、薄云：《亚洲金融危机时期的高等教育经费政策》（研究报告），2012年12月被教育部财务司采纳。

9.陈武元：《福建省社会科学研究基地建设管理办法（草案）》（研究报告），2014年11月被福建省社科联采纳。

1.亚太地区私立高等教育政策研究（项目负责人），教育部人文社会科学规划项目（2001—2004年），已结项。

2.中国大学人文社会科学科研组织模式创新研究——以教育部人文社会科学重点研究基地为例（项目负责人），教育部人文社会科学规划项目（2009—2012年），已结项。

3.现代大学制度与高校财务治理（子项目负责人），教育部重大课题攻关项目（2007—2010年），已结项。

4.高等院校参与扩大内需问题研究（子项目负责人），教育部财务司委托项目（2008—2009年），已结项。

5.福建省哲学社会科学“十二五”发展规划（项目负责人），福建省社会科学规划重大项目（2010-2011年），已结项。

6.福建省社会科学研究基地建设管理办法编制研究（项目负责人），福建省社会科学规划重大项目（2015-2016年），已结项。

7.福建省哲学社会科学研究“十三五”规划（项目负责人），福建省社会科学规划重大项目（2015-2016年），已结项。

8.我省终身教育体系与学习型社会的构建研究（项目负责人），福建省社会科学研究“十五”规划一般项目（2003—2005年），已结项。

9.构建和谐福建与大众化教育发展研究——调整高校专业结构，促进海西经济区建设（项目负责人），福建省社会科学研究“十一五”规划一般项目（2007—2009年），已结项。

10.福建省民办高等教育发展的制度环境选择（项目负责人），福建省社会科学研究“十一五”规划一般项目（2008—2010年），已结项。

11.哲学社会科学机构、职能与管理（项目负责人），福建省社会科学规划项目（2010-2012年），已结项。

12.厦门大学人文社会科学评价指标体系研究（项目负责人），厦门大学校级重点课题（2001—2003年），已结项。

13.深圳市民办教育规范化管理及发展研究（子项目负责人），深圳市教育局委托项目（2005年），已结项。

14.厦门市民办高等教育研究（项目负责人），厦门市教育局委托项目（2008—2009年），已结项。