李奇渊教授
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实验室网址：http://team.xmu.edu.cn/DrQLab/zh_CN/index.htm
个人简介
李奇渊博士，国家高层次青年人才、福建省高层次人才、厦门大学南强青拔人才，厦门大学医学院教授、博士生导师，厦门大学健康医疗大数据国家研究院副院长。主要致力于计算医学、生物信息学等方面研究。兼任福建省生物信息学学会副会长、中国优生优育协会专业委员会副主任、中国医疗器械行业协会医疗器械物联网管理专业委员会智慧医疗专家组副组长、厦门大学医学院医学伦理委员会委员、中国卫生信息与健康医疗大数据学会三医联动健康保障分会常务理事、数字福建健康医疗大数据研究所副所长、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会委员。Frontiers in Genetics、Frontiers in Pediatrics杂志专题编辑。李奇渊教授已在包括Genome Medicine，Briefings in Bioinformatics等国际知名期刊上，以第一作者或通讯作者的身份发表发表了SCI论文57篇，H-index 36，论文累计他引10884次。目前主持2项国家自然科学基金面上项目、7项市级研究项目，参与多项国家级、省部级、市级研发项目，总支持经费2千万元。
代表性成果
1. Huanhuan Liu, Qinwei Chen, Jintao Guo, Ying Zhou, Zhiyu You, Jun Ren, Yuanyuan Zeng, Jing Yang, Jialiang Huang, Qiyuan Li*, Epigenome-augmented eQTL-hotspots reveal genome-wide transcriptional programs in 36 human tissues, Briefings in Bioinformatics, 2024, 25(3): bbae109.
2. Qingqing Qin, Ying Zhou, Jintao Guo, Qinwei Chen, Weiwei Tang, Yuchen Li, Jun You, Qiyuan Li*. Conserved methylation signatures associate with the tumor immune microenvironment and immunotherapy response. Genome Medicine 16, 47 (2024).
3. Jun Ren, Xuejing Lyu, Jintao Guo, Xiaodong Shi, Ying Zhou, Qiyuan Li*.CDSKNNXMBD: a novel clustering framework for large-scale single-cell data based on a stable graph structure[J]. Journal of Translational Medicine, 2024, 22(1): 233.
4. Xuejing Lyu; Shaona Wang; Jiaxin Zhong; Lingzhu Cai; Yanhui Zheng; Ying Zhou; Ying Zhou;Qionghua Chen; Qiyuan Li* ; Gut microbiome interacts with pregnancy hormone metabolites in gestational diabetes mellitus, Frontiers in Microbiology, 2023, 14.
5. Jintao Guo, Ying Zhou, Chaoqun Xu, Qinwei Chen, Zsófia Sztupinszki, Judit Börcsök, Canqiang Xu, Feng Ye, Weiwei Tang, Jiapeng Kang, Lu Yang, Jiaxin Zhong, Taoling Zhong, Tianhui Hu, Rongshan Yu, Zoltan Szallasi, Xianming Deng, Qiyuan Li*; Genetic Determinants of Somatic Selection of Mutational Processes in 3,566 Human Cancers, Cancer Research, 2021, 81(16):4205-4217
其他发表论文链接：
https://scholar.google.com/citations?user=WGvpT-8AAAAJ&hl=zh-CN
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专利:
1. 实体肿瘤的临床预后基因标签, 美国专利申请号 No. 61/175,781
软件著作：
1. 单细胞数据的无偏降采样系统 [简称:MURP]V1.0 2023SR1327445
2. 从超低深度全基因组测序中分析肿瘤体细胞突变标签的软件 [简称:ulcSig]V1.0 2023SR1565307
团队成员：
1.郭嘉阳，助理教授， 主要从事儿童癫痫脑电波深度学习方面的研究。
2.周颖，实验师，主要从事肿瘤基因组及致病机制方面的研究。
3.钟桃玲，助理实验师，主要从事医疗大数据方面的研究。
4.郭金涛，博士后，主要从事肿瘤基因组及NIPT方面的研究。
